新《企业所得税法》实施后，内外资企业享受同等国民待遇，取消了税收减免优惠政策（部分鼓励性行业或产品除外）。南京公司税收优惠政策主要以返税为主，即公司交纳税收后，再将部分税收返还给企业，包括公司营业税、增值税、企业所得税。南京市区与开发区，各开发区之间，返税优惠政策差异很大。
南京返税优惠政策是大陆其它省份或城市难以比例的，是吸引国内及海外投资的重要因素。
南京的税收是各级分成的，除了国家部分的税收保留外，地方税收是由市政府、区政府、开发区、企业进行分成。
一、国家与地方税收分成体系：
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国家/地方 |
增值税 |
营业税 |
所得税 |
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国家财政 |
75% |
0% |
60% |
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地方（省/市）财政 |
25% |
100% |
40% |
二、南京市税收分成体制 南京市地方财政税收分成体制：
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区域 |
市财政 |
区财政 |
开发区 |
企业 |
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溧水、高淳 |
0% |
20-30% |
70-80% |
40%以上 |
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其它郊区 |
40% |
20-30% |
30-40% |
20-30% |
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市区 |
40% |
20-30% |
30-40% |
15%-22% |
三、南京公司税收返税比例：
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返税等级 |
区域 |
增值税 |
营业税 |
所得税 |
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最高返税 |
六合区 |
返10%以上 |
返45%以上 |
返18%以上 |
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中等返税 |
溧水、高淳 |
返6-8% |
返15-30% |
返10-18% |
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最低返税 |
市区 |
返1.5-4% |
返6-15% |
返2.4-6% |
上述所说返税比例是以实际交税额为基数。以企业营业税/增值税交税额100万为例，企业在不同区域所得返税具体数额：
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区域 |
增值税交税100万，返税额 |
营业税交税100万，返税额 |
所得税交税100万，返税额 |
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六合区 |
10万以上 |
45万以上 |
18万以上 |
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溧水、高淳 |
6-8万 |
15-30万 |
10-18万 |
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市区 |
1.5-4万 |
6-15万 |
2.4-6万 |
备注
1、一般开发区或招商代理公司所宣称的“返地方所得税收的多少”，其实是很模糊的说法。地方所得税收即可以指除国家外的地方税收，也可指区所留税收，还可以指开发区所留税收，而且不同级别的开发区所留税收是不一样的。因而，在考虑注册在哪个区或哪家开发区时，一定要明白其给企业真实的返税是多少，一般用“返实际交税额的多少”比较科学。
2、返税一般是开发区或招商公司将税收直接返给企业，一般按季度、半年度、年度返还给企业，先征后返。
注册公司前，需了解注册所在地的税收优惠政策，以便享受最优惠的税收政策，节约公司成本。
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